针对基因领域的PaaS平台在国外起步比较早,代表性企业有Seven Bridge , DNAnexus, Tute Genomic等等。而近些年,国内的生物信息云服务商开始走向市场。 其中一部分是进行业务拓展的早期企业,比如华大和百迈客生物。另一类则是像聚道科技,华点云这样以云服务为核心的初创公司。基因组数据的产生规模与测序成本息息相关,这些企业成立时间与测序成本下降时间节点基本吻合。 2013年,原华大生物信息骨干陈晨从中国疾病预防控制中心传染病所生物信息室主任的位置上辞职,创办了专门面向临床生物信息服务的华点云。华点云部署在华为云平台上,积累了500多项生物信息应用,针对临床实验室缺乏生物信息解决方案的痛点,提供生物信息数据分析和报告。 不同与华点云,聚道科技则从数据的安全、高效和易用性入手,提高数据传输效率和软件运行效率,为想用云计算但不知道如何使用的生物公司提供云计算资源调度服务。 2014年,一批阿里出身的技术团队成立了基因大数据计算服务平台聚道科技。平台可提供基因数据的传输、存储、分析、计算和应用的一体化解决方案,将生物信息云服务化。同时提供开放的接口,让用户能够方便的来管理和操作数据,最后根据用户需求生产报告。 另外,通过运用数据压缩技术来减少传输和存储的时间及成本,使用分布式调度和执行引擎来加速数据分析速度和通量,聚道 提供的云服务不仅可以帮助用户减免硬件的维护和更新费用,还可以降低数据分析的成本门槛。同时,基于这样的云平台,使得许多复杂的,本地不可承受的多样本分析任务不再受制于有限的本地数据处理能力。 一方面是这些以云服务为核心的初创企业崛起,另一方面,产业链中游或者综合业务的企业也在积极迎接这股云潮流。 2015年4月,凭借丰富的下一代测序数据分析经验,华大基因开发了基于“云”的解决方案BGI Online,来应对海量下一代测序数据的分析、存储和共享的传统难题。 BGI Online拥有强大可靠的基础设施和一流的安全性,可为各种类型、大小的机构提供数据存储、自动化分析、数据传输、生物信息方法开发和共享服务。该平台使用了最先进的资源管理系统,以确保资源在运行计算任务时的精准分配和实时的任务监控,并对可能遇到的错误进行及时反馈。 在这样一个平台上,用户可以基于华大基因的开源软件,创建自己的分析工具。更重要的是,用户的分析工具还可以与BGI Online平台的公共分析工具、生物信息分析工具和其他资源相融合,从而建立一整套更符合用户自身研究需求的分析流程。 2016年2月,BGI Online beta版本在阿里云上线,这也是首个完全部署在阿里云上的大规模生物信息分析平台。依托阿里云的弹性存储和计算优势,BGI Online不但可以满足基础科研、农作物育种及临床应用等不同应用场景和模式对数据处理、存储和传输的需求,还通过使用一系列先进的数据技术,满足HIPAA法案等行业安全条例的要求。 同时,使用内资服务器存储和分析敏感的基因数据也更加符合我国《人类遗传资源管理办法》的规范。简洁易用的界面和高度安全的特性,使医生和研究者们可以把管理数据、硬件维护等繁杂的工作交给BGI Online和阿里云,从而更专注于他们要解决的科学和临床问题。 这意味着,对于科研院所、医疗机构及中小型基因行业创业公司来说,只要拥有基因数据,不必自建和维护昂贵而复杂的计算、存储平台,通过BGI Online便可以解码神秘基因背后的奥秘。这家全球最大的基因组学研发机构打开了基因行业这扇神秘大门,让基因行业变得“触手可及”。 当然,华大并非是唯一一家进行云业务拓展的企业。2015年7月,百迈客也推出了为科研人员量身定制的生物大数据信息分析平台百迈客云,为用户提供完整的生物信息分析以及整合利用公共数据的解决方案。 除了中游企业,一些传统生物信息公司,比如烈冰科技、美吉生物旗下桑格信息也在积极的往云上转移。 另外,像是加速芯片和数据压缩工具等辅助性软件也在数据处理环节发挥着辅助作用。这类产品的作用并不是解决什么问题,而是如何将这个问题更好的解决。比如更高效的计算、更快速高质量的压缩等等。目前,涉及辅助性软件的企业比较少,基于这类产品的自身属性,形成专职企业的可能性不大。 2、SaaS:数据分析的云上APP (责任编辑:本港台直播) |