该研究发现约有4%的中国患者携带有新发突变，这些新发突变分布于29个风险基因上，其中以基因SCN2A的新发突变率最高（约1.1%）。这组数据说明了什么？基因SCN2A的新发突变的意义是什么？

　　夏昆：这组数据，一方面说明这些基因是中国人群孤独症的高风险基因，仅在29个基因上就发现4%的患者携带新发突变，更多的风险基因和更高比例携带新发突变的患者将会在更大样本和更广泛基因组水平的检测上被发现；另一方面说明孤独症具有高度的遗传异质性，单个基因或变异只能解释极小部分的患者。有趣的是，我们发现SCN2A的新发突变率在中国孤独症人群中高达1.1%， SCN2A编码离子通道蛋白，某些针对离子通道开发的神经精神药物可能对于改善这些患者的临床症状具有一定的作用。这给GPCA研究的临床转化赋予了更重要的意义。

　　该项目第一期针对189个国际上已发现的孤独症风险基因做了靶向捕获测序，是否是对西方人群研究的验证，并试图发现新的基因？

　　夏昆：这项研究并不是简单的对西方人群患者风险基因的验证。只是因为目前尚缺乏中国人群孤独症大规模的基因组测序研究，我们主要根据此前西方人群的测序研究所提示的高风险基因，结合其他一些研究以及我们已有的研究基础，加入了部分尚未被明确提示为孤独症的风险基因，希望在鉴定中国人群孤独症的遗传图谱的同时，能够鉴定更多新的风险基因。另外一个重要的目的是进行孤独症高风险基因的表型研究，希望通过GPCA思路能够定义更多的孤独症临床亚型。

　　一项高效、快速且成本低廉的研究方法

　　此次孤独症基因型-表型关联研究计划，atv，运用一种新的高效、快速且成本低廉的靶向捕获技术——分子倒置探针（Molecular Inversion Probes, MIPs）方法。在1543例中国人群孤独症患者中完成了针对189个前期研究所提示的孤独症风险基因的靶向捕获测序，这是国内第一次完成的大规模中国人群孤独症样本的候选基因靶向测序。

　　分子倒置探针技术图示（O’Roak, et al, Science, 2012）

　　此次研究采取了新探测方法——靶向捕获-分子倒置探针技术，其特点是什么？它和以往其他技术有什么区别呢？

　　夏昆：这个方法的特点是能够自主设计、靶向捕获感兴趣的特定区间，同时其优点是高效、快捷且价格低廉，非常适用于像我们这样针对大样本量的候选基因测序研究。相比其他技术，优势是该方法所获得的测序深度较深，数据更可信，同时还可能发现一些其他方法不能检测到的盲区。但是该方法也有一些固有特性，由于实验需要经过PCR过程，所以目前对于高GC区间和高度重复序列区间的捕获效率还有待提高。

　　现有的研究分为两期，第一期样本数为1543例，第二期样本数计划为3000例，如此规模的样本是不是在国际上也是首次？为什么要取如此多样本？

　　夏昆：GPCA是一个长期连续性的研究计划，目前第二期已经完成和第一期相当的样本量，总计已经完成了3000多例患者。如此规模的样本在国际上并不是首次，比如SSC（Simons Simplex Collection）已经完成2500多个孤独症家庭外显子组测序，ASC（Autism Scimplex Collection）也已经完成了4000多例孤独症样本的测序。需要如此多的样本主要还是因为它的临床表型和遗传病因异质性的问题。孤独症的这一特点也是我们研究的一个优势，中国人口基数大，临床遗传资源丰富，虽然国内研究起步较晚，但我们相信能够迎头赶上，甚至做得更好。

　　与以往的孤独症基因研究相比，孤独症基因型-表型关联研究计划除了具有新技术-靶向捕获技术，有什么其他优势和不足？