2010年以来，防城港市北仑河口国家级自然保护区核心区违法建设竹山村旅游栈道1397米，破坏红树林6.3亩，栈道附近7家“渔家乐”生活污水直排，atv，截至督察时仍在违规经营。合浦儒艮国家级自然保护区部分海域被养殖侵占，侵占面积达349.2公顷，其中核心区144公顷。

　　桂林漓江流域非法采石问题突出，也成为督察反馈的主要内容。

　　漓江国家级风景名胜区内有18家采石场，其中2家位于核心景区。桂林市海洋山自治区级自然保护区恭城县境内有3家采矿企业、6个采矿区，许可开采面积达58.4平方公里，长期违规开采，生态破坏严重。崇左市大新县恩城国家级自然保护区内有3个采石场，下雷自治区级自然保护区内有2个采石场，合计侵占保护区面积10.2公顷。

　　桂林千家洞国家级自然保护区内5座小水电站中，有3座部分构筑物位于核心区和缓冲区，其中位于核心区的道江河水电站新大坝，2014年仍获得有关部门违规批准施工。

　　此外，督察进驻期间，群众还对玉林市生猪养殖场和水洗企业群、桂林市垃圾和医疗废物处置、防城港市炼铁企业、百色市铝土矿开采、梧州市宝石加工小作坊，以及贵港、柳州、崇左、百色建材企业等环境污染问题投诉集中。