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wzatv:【图】金鑫:基因应用现状解析及华大基因的数据平台架构(2)

时间:2017-05-23 04:27来源:118图库 作者:本港台直播 点击:
基于上述挑战,华大基因通过阿里云为BGI Online(安全、?效、易?的?物信息服务云 平台 ,为?物信息领域的各类科研工作者和工具开发者提供便利)注入弹性,

  基于上述挑战,华大基因通过阿里云为BGI Online(安全、?效、易?的?物信息服务云平台,为?物信息领域的各类科研工作者和工具开发者提供便利)注入弹性,同时也释放了每个数据中心部署耗费的大量人力、财力和物力,其总体架构如下:

  

wzatv:【图】金鑫:基因应用现状解析及华大基因的数据平台架构

  前端通过WEB服务呈现系统业务和提供用户操作,WEB请求通过SLB做负载均衡,并在阿里云提供的VPC和云盾的防护下提供高可用的服务。

  后端管理系统的业务数据和处理业务逻辑,后端服务部署在多台ECS上,并采用RDS服务存储业务数据。

  任务管理引擎接受前端请求,管理计算资源实现生物信息数据的分析,阿里云提供了海量的ECS节点,并对每个ECS节点提供了完整、详细的API文档,通过对接ECS节点实现了计算资源的弹性伸缩和强大的分布式计算能力。

  存储管理负责基因数据的存储和管理,运用OSS和OAS实现了基因数据的冷热存储,除了OSS和OAS本身提供的加密存储外,还对接OSS服务实现数据的去身份化,提高了平台的安全性。

  文件传输通过部署在ECS上的服务提供,庞大的基因数据上云是数据流的起始端和瓶颈,阿里云通过铺设阿里机房到华大集群的专线,提升了数据传输的速度。

  而就在去年,基于华大基因开发的新一代基因云计算平台BGI Online,华大基因、阿里云和安徽医科大学三方共同协作在21小时47分12秒内完成了1000例人类全外显子组数据的分析,创造了基因数据分析的“深圳速度”。

  人人服务,基因研究未来的发展

  基因行业还在非常早期,现在看到的就是一些非常确定的应用,和非常确定的结果——金鑫。

  如果只有一份基因数据,能解释的事情非常少,同时在人的基因之外,动植物、甚至是微生物这些组成人类生活环境的因素同样需要分析。因此,去年建立了我国第一个也是唯一一个国家基因库(由华大基因承接和运营)。而在这之外,华大基因更与多家国际组织达成合作,比如IRDiRC国际罕见病研究联盟,也比如与费城儿童医院在儿童脑癌上的研究。

  同时金鑫还表示,时下云计算、大数据、人工智能等技术同样会给基因研究带来很大的助力,比如在计算、存储之外,华大基因已与阿里云展开了大量机器学习相关方面的合作,比如说预测小米性状,通过小米的基因数据,种植环境来预判小米的产量、特性等。同时也正在与阿里云合作,通过更好的算法去预测肿瘤的驱动基因。

  在最后,金鑫再次强调了基因研究上“我为人人”这个概念,他表示,就如BGI Online生物信息数据云平台,基于云基础设施能够搭建不同的基因数据分析场景,不同的人可以在上面搭建自己的分析流程,为?物信息领域的各类科研工作者和工具开发者提供便利。

(责任编辑:本港台直播)
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